Etude des interactions Enzyme-Ligand. Cas des inhibiteurs de l’acétylcholinestérase

Abstract

يشض انضىب شًٌ ى عببسة عن انتكبط ف انذيبغ ىً يشتبػ يع اظؽشاببث سبئذة ف انزاكشة ، اظؽشاببث يعشف تٍ أ سه كٌ تٍ نًيب تأح شٍ عهى انح بٍة ان يٌٍ تٍ نه شًطٌ. ف بحخنب ىزا سهؽنب انع ءٌ عهى علاد يشض انضىب شًٌ انزي عٌت ذً عهى تخب ػٍ الأست مٍ ك نٌ نٍ استشاص . سٌتخذو ىزا الإنض ىٌ ف تنظ ىٍ انتقبل انس بٍنت انعصب تٍ ين خلال انتحهم انسش عٌ نلأست مٍ ك نٌ نٍ. ببستخذاو ؼش قٌت ) docking ( ب اٌسؽت بشنبيذ ' Molegro Virtuel Docke ' , ق نًب بتق ىٍٍ نشبغ انتخب ػٍ نخلاث يخبؽبث يشي سٌة، ىًً : Tacrine ، Galantamine ، . Donepezil عٌتبش" Donepezil " ان خًبػ الاكخش فبعه تٍ 0,007μM) = (IC50 ي بً تٌ اٌفق يع ؼبقت انشبػ ان حًس بٌت ببستع بًل انبشنبيذ. اغهب انش اًبػ انت تع مً عه استقشاس ىزه ان خًبؽبث راث ؼب عٍت ى ذٍس فً بٌ تٍ ) hydrophobiques ( سً اًبػ ى ذٍس رً نٍ تٍ. بعذ رنك ق نًب بذساست آن تٍ انتخب ػٍ ن شًكب ' Linalol ' ىٌ عببسة عن يخبػ ؼب عٍ ين فئت ” monoterpène” ح جٍ انو لا ت رٌذ اي دساست سببقت نيزا ان شًكب ببستع بًل ”Docking” . ف ان شًحهت الأخ شٍة بًبلاستعبنت ببننتبئذ انسببقت حب نًنب إ زٌبد يخبؽبث رذ ذٌة يشتقت ين Linalol اكخش فعبن تٍ ينو. ؼش قٌت ”Docking” تعتبش ين أفعم انتقن بٍث ان سًتع هًت حبن بٍ نتؽ شٌٌ عشض يخبؽبث La maladie d’Alzheimer est une affection dégénérative du cerveau qui associe des troubles prédominants de la mémoire, des troubles cognitifs et/ou du comportement ayant un retentissement sur la vie quotidienne des patients. Dans notre travail, nous sommes focalisés sur le traitement d’Alzheimer basé sur l’inhibition de l’acétylcholinestérase. Une enzyme sert à la régulation de la transmission de l’influx nerveux en assurant l’hydrolyse rapide de l’acétylcholine. En faisant appel aux méthodes de modélisation moléculaire plus particulièrement le docking par le programme Molegro Virtuel Docker, nous avons évalué l'activité inhibitrice de trois inhibiteurs décrits par la littérature comme inhibiteurs potentiels de l’acétylcholinestérase. Il s'agit de : la Tacrine, la Galanthamine, le Donepezil. La Galanthamine présentant l'IC50 le plus bas (IC50 = 0,007μM) a donné par simulation avec MVD la meilleure affinité d'interaction. Les interactions qui gouvernent la stabilité des différents complexes sont de type hydrophobiques et liaisons hydrogènes. Ensuite nous allons étudier le mécanisme d’inhibition mis en place par le Linalol : un inhibiteur naturel appartenant à la classe des monoterpènes. Dans la mesure où aucune étude préalable de modélisation par docking moléculaire de ce composé n’a été réalisée. Dans une dernière partie, en nous appuyant sur les résultats précédents, nous avons tenté de modéliser de nouveaux inhibiteurs, dérivé de Linalol, pouvant inhiber plus fortement l’acétylcholinestérase. L’approche in silico par MVD s’avère donc une méthode fiable pouvant contribuer de manière efficace au développement de nouveaux inhibiteurs d’une enzyme donnée. Mots clés : Molegro Virtuel Docker ; Docking moléculaire; Inhibiteur Acétylcholinestérase; Interaction hydrophobique ; Liaison hydrogène ;