07.Faculty of exact science_master

Permanent URI for this communityhttps://dspace.univ-eloued.dz/handle/123456789/16

Browse

Browsing 07.Faculty of exact science_master by Subject ""الإلتحام الجزيئي، بروتينات الصدمة الحرارية، السرطان، مثبطات،Molegro Virtuel Docker ""

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 1 of 1
  • No Thumbnail Available
    Item
    Modélisation des interaction HsP90-inhibiteur à l'aide de technique de docking moléculaire
    (universty of elouedجامعة الوادي, 2021-02-13) العابد, مريم
    "السرطان مرض ناجم عن تحول الخلايا التي تصبح غير طبيعية وتتكاثر بشكل مفرط. تنتهي هذه الخلايا المضطربة أحيانًا بتشكيل كتلة تسمى الورم الخبيث. في عملنا، نركز على علاج السرطان بناءً على تثبيط بروتينات الصدمة الحرارية (Hsp90). بروتين مرافق تنتجه الخلايا إستجابة للتعرض لظروف مرهقة. بإستخدام طرق النمذجة الجزيئية، وتحديدًا الإلتحام الجزيئي ((docking moléculaire بواسطة برنامج Molegro Virtual Docker، قمنا بدراسة الأنماط المحتملة للتفاعل بين بروتين الصدمة الحرارية (Hsp90) و4 مركبات موصوفة بيبليوغرافيا على أنها مثبطات قوية لـبروتين Hsp90 هي: Deguelin، Radicicol، Geldanamycin وTanespimycin. الخوارزمية المعتمدة خلال هذه الدراسة هي MolDock ptimizer ودالة الحرز المعتمدة هيMolDock Score، وللتحقق من كفاءة البرنامج المستخدم يحسب مقدار إنحراف الجذر التربيعي (RMSD) والذي وجدناه أقل من 2A°، مما يثبت نجاعة هذا البرنامج. تظهر النتائج التي تم الحصول عليها على ألفة كبيرة بين المركبات المدروسة والأحماض الأمينية المكونة للتجويف الرئيسي لهذا البروتين. ينتج هذا الإستقرار عن تشكل روابط هيدروجينية، العديد من التفاعلات الكارهة للماء، وتفاعلاتVander Waals""Le cancer est une maladie provoquée par la transformation de cellules qui deviennent anormales et prolifèrent de façon excessive. Ces cellules déréglées finissent parfois par former une masse qu'on appelle tumeur maligne. Dans notre travail, nous sommes focalisés sur le traitement du cancer basé sur linhibition de la protéine de choc thermique (Hsp90). Une  protéine chaperon  produite par les cellules en réponse à une exposition à des conditions de stress. En faisant appel aux méthodes de modélisation moléculaire plus particulièrement le docking par le programme Molegro Virtuel Docker, nous avons étudié les modes dinteractions possibles entre la protéine de choc thermique (Hsp90) et 4 composés décrits par la littérature comme inhibiteurs puissantes de la Hsp90, Il s'agit de: Deguelin, Geldanamycin, Radicicol, Tanespimycin. Cette étude a été assistée par le programme MVD en utilisant MolDock Score comme algorithme de recherche et MolDock Score comme fonction de score. Lefficacité du protocole combinant ces paramètres a été validée avec une simulation de re-docking avec un RMSD inferieur à de 2 Å. Les résultats de docking des composés étudiés montrent une grande affinité avec les résidus de la cavité principale de cette protéine donnant des valeurs des énergies importantes. Cette stabilité exprimée résulte de la mise en place des liaisons hydrogène, des plusieurs interactions hydrophobe, et des interactions de Vander Waals vis-à-vis des résidus principale. "